Sebagai sekolah di bawah naungan Persyarikatan Muhammadiyah, SMK Muhammadiyah 2 Sukoharjo memadukan pembelajaran kejuruan dengan pembinaan karakter Islami. Pembelajaran Al-Islam dan Kemuhammadiyahan menjadi bagian dari kurikulum, dilengkapi pembiasaan ibadah dan adab dalam keseharian di sekolah.
Tujuannya agar lulusan tidak hanya terampil, tetapi juga berakhlak mulia, jujur, disiplin, dan bertanggung jawab di dunia kerja maupun masyarakat.